馒头在冷藏环境下淀粉很容易老化变硬，细菌也会慢慢滋生。如果不密封直接裸露存放，水分快速流失，通常1天就会发干，放置2天就可能发酸、表层滋生细菌，不建议继续食用。
若用保鲜袋排尽空气密封严实存放，最多可以存放3至4天，最好在2到3天内吃完。超过4天馒头容易发黏、带有酸味，存在变质风险，不建议食用。
晾凉后的馒头分装密封冷冻，能锁住水分、抑制微生物繁殖。在密封完好、无反复解冻化冻的前提下，**1个月之内食用口感最佳**，馒头松软度和风味基本不会变差；最长储存不要超过2～3个月，存放过久会大量失水干裂、口感干柴发渣，营养与风味大幅流失。
一旦馒头出现表皮发黏、散发酸味或酒味、长出霉斑，哪怕只一小块发霉，整只馒头都需要直接丢弃，霉菌毒素会渗透整体，切掉发霉部分也无法安全食用。冷冻馒头无需提前解冻，水开后上锅蒸十几分钟就能恢复松软口感。
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